Ўзини ўзи бошқариш ёшлар ишлари агентлиги кенгаши стратегик муҳим муаммоларни ҳал этишда ҳамжамият тамойилига асосланган жамовий маслаҳат органи ҳисобланади.

Ёшлар ишлари агентлиги кенгашининг асосий мақсади ТХКМРМ да таҳсил олаётган клиник ординаторларнинг, ташкилотларнинг ёш мутахассисларининг фаолиятини мувофиқлаштириш орқали ёшлар ишлари агентлиги фаолиятида иштирок этиш ҳуқуқларини рўёбга чиқариш корпоратив маданиятни шакллантириш ва клиник ординаторлар ташаббусларини қўллаб-қувватлашдан иборат.

Кенгашнинг асосий мақсадлари қуйидагилардан иборат:

• Турли бўлимлар ўртасида тузилмалараро ўзаро ҳамкорликни шакллантириш;
• ТХКМРМ клиник ординаторларининг ташаббусларини қўллаб-қувватлаш;
• Клиник ординаторларинингг ўзини ўзи бошқариш органлари фаолиятида иштирок этишга бўлган қизиқиш даражасини ошириш;
• Ёш олимлар ва жамиятнинг ўзаро ҳамкорлиги масалалари бўйича университетлараро, минтақалараро ва халқаро алоқаларни мустаҳкамлаш;
• Ёш олимлар ва мутахассисларнинг фуқаролик маданиятини, фаол фуқаролик позициясини шакллантириш, уларнинг ижтимоий етуклиги, мустақиллиги, ўзини ўзи ташкил этиш ва ўз-ўзини ривожлантириш, қобилиятини ривожлантиришга кўмаклашиш;
• Клиник ординаторларга ёшлар ишлари агентлиги тузилмасида иштирок этиш ва ижодий, спортни ривожлантириш учун шароит ва имкониятлар ҳақида маълумот бериш;
• Ёшларнинг бўш вақтини ташкил этиш, спорт ва волонтёрлик ғояларини ривожлантириш.