Бўлимнинг мақсади марказнинг самарали фаолият кўрсатиши ва юқори рейтинг кўрсаткичларига эришиши учун зарур молиявий шарт-шароит яратиш ҳамда марказ моддий-техника базасини кучайтириш мақсадида бюджет ва бюджетдан ташқари маблағлар тушумидан оқилона ва самарали фойдаланилишини таъминлаш, харажатларни молиялаштиришда тасдиқланган режа (смета) ва лимитлар доирасидан чиқмасликка эришиш, марказнинг жорий ва истиқболдаги иқтисодий ҳолатини янада яхшилаш юзасидан таклифлар ишлаб чиқишдан иборат.

Бухгалтерия бўлими ўз фаолиятини Ўзбекистон Республикаси қонунлари, Ўзбекистон Республикаси Президентининг фармон ва қарорлари, Вазирлар Маҳкамасининг қарорлари, Ўзбекистон Республикаси Олий ва Ўрта махсус таълим вазирлиги Хайъат қарорлари ҳамда буйруқлари, Марказ Кенгаши қарорлари ва директор буйруқлари, марказ Устави ва бухгалтерия бўлими Низоми асосида олиб боради.

Бухгалтерия ҳисоби бўлимининг асосий вазифалари:

• Бухгалтерия ҳисобларида Марказ фаолиятининг иқтисодий жараёнлари ва молиявий натижалари тўғрисида оператив бошқариш, шунингдек солиқ ва молия органлари, банклар ва бошқа манфаатдор ташкилотлар томонидан фойдаланиш учун зарур бўлган тўлиқ ва ишончли маълумотларни шакллантириш.
• Мол-мулкнинг мавжудлиги ва ҳаракати, моддий, меҳнат ва молиявий ресурсларнинг тасдиқланган нормалари, стандартлар ва сметаларга мувофиқ ишлатилиши устидан назоратни таъминлаш;
• Самарали бошқарув учун бухгалтерия ҳисоби ва ҳисобот маълумотларини умумлаштириш.
• Молиявий, солиқ, статистик ва бошқа ҳисоботларни тайёрлаш.
• Бухгалтерия бўлими мулк, мажбуриятлар ва бухгалтерия ҳисобини юритади.
• Марказнинг ҳисоб сиёсатини шакллантиради, унга жавоб бериши керак тўлиқлик -  эҳтиёткорлик, мазмуннинг шаклдан устунлиги, изчиллик ва ратсионаллик талаблари.
• Бухгалтерия ишининг ташкилий шаклини мустақил равишда белгилайди.
• Юридик маслаҳатчи билан биргаликда шартноманинг бажарилиши мажбуриятларини назорат қилади.
• Белгиланган меъёрий ҳужжатларга мувофиқ инвентаризатсияни, асосий воситаларни ва инвентарларни қайта баҳолашни (керак бўлса, мутахассисларни жалб қилган ҳолда) амалга оширади.