Kafedra dastlab 1936-1948-yillarda "Epidemiologiya" kafedrasi tarkibida tashkil etilib, 1948-yildan boshlab mustakil "Mikrobiologiya" nomi bilan faoliyat yuritgan.
Kafedra mudirlari:
1920 yildan 1954 yilgacha – professor Grekov A.D.
1954 yildan 1965 yilgacha – professor Ashmarin I.I. 
1965 yildan 1988 yilgacha – professor Kocherovskiy Yu.E.
1988 yildan 2012 yilgacha – professor Isxakova X.I. 
2012 yildan 2022 yilgacha – dotsent Shadmanova N.A. 
2022 yildan to hozirgi kungacha t.f.n. Sayfutdinov Z.A.