Кафедра создана в 1924 году при Среднеазиатском государственном университете, позднее ТашГосМИ. Организована в 1939 году как база скорой медицинской помощи с фондом в 140 коек.

В ВОВ кафедрой возглавлял профессор Г.А. Ротенберг. Тогда главной задачей кафедры была подготовка военных врачей.  В связи с выходом на пенсию проф. Г.А. Ротенберга с 1953 года кафедрой возгавлял доц. М.И. Гаспарян (1953-1964).

В 1964 году избрана Муратова Ханифа Нурулловна (1964-1979). В 1965 году ей было присвоено звание профессора, в 1969 году — звание заслуженного деятеля науки СССР. Под руководством её защищены 1 докторская и 8 кандидатских диссертации.

В 1975-1996 годах заведующей кафедрой работал доцент Ильясов Шокосим Шохизирович. С 1996 года база кафедры перенесена в Республиканский центр специализированной хирургии имени академика В. Вохидова.

С 1996 по 1998 год и по настоящее время кафедру возглавляет доктор медицинских наук, профессор, академик Назиров Феруз Гафурович. После того, как база кафедры была передана РСЦХ имени академика В.Вахидова, академик Назиров Ф.Г. квалифицированный хирург, многопрофильный специалист создал уникальные возможности для развития кафедры, расширил теоретическую и практическую базу.

С 1998 по 2004 год кафедру возглавлял доктор медицинских наук, профессор Абдулла Маткаримович Худайбергенов. Профессор Худайбергенов А.М., имеющий большой организационный, научно-педагогический и практический опыт продолжая традиции кафедры, внедряя новые тенденции в медицине Узбекистана, он применил к процессу новый методы преподавания. Благодаря всем возможностям базы, в кафедре применены новейшие практические достижения хирургии.

С 2004 года кафедру возглавляет доктор медицинских наук, профессор Хабибулла Атауллаевич Акилов. С 1998 по 2003 годы работал директором «Республиканского центра специализированной хирургии имени академика В.Вахидова» и по совместительству работал профессором кафедры госпитальной хирургии и магистратуры первого ТашГосМИ. С 2017 года является ректором ТашИУВ и заведующим кафедрой хирургии и детской хирургии.

В 2015 году решением Ученого совета ТашИУВ на базе кафедры хирургии и детской хирургии создана 1-я кафедра хирургии. До настоящего времени 1-ю кафедру хирургии возглавляет академик Назиров Ф.Г.