Кафедра впервые основано в 1946 году в составе Ташкентского Медицинского Института. Первым заведующим кафедрой был профессор Л.Д.Василенко.
Постепенно в профессор - педагогический состав кафедры обогащался другими ведущими специалистами того времени, которые считаются основоположниками отдельных разделов онкологии. Последующем кафедрой заведовали Б.Н.Калмыков (1949г), профессор А.А.Эпштейн (1950-1952гг), к.м.н. Т.Х.Хасанов (1953-1959гг). Все вышеперечисленные руководители вносили особый вклад в развитии онкологии как отдельный раздел медицины и для подготовки специалистов-онкологов Узбекистана.
1959-1972 года кафедрой руководил профессор Б.Л.Бронштейн, в периоде которого разработаны первые учебно-методические программы для подготовки онкологов и учебные циклы усовершенствования врачей-онкологов. Б.Л.Бронштейн одновременно являлся «Педагогом» с большой буквой и практическим хирургом – онкологом. Кроме это он являлся ведущим ученом того времени и 1962 году одним из первых выпустил монографию «Рак прямой кишки». В периоде его руководство на кафедре онкологии было подготовлены более 10 докторский и кандидатский диссертации по онкологии.
С 1973г. по 1986 год заведующим кафедрой онкологии работал профессор В.Г.Ходжаев. Он являлся ведущим специалистом онкологом по опухолям головы и шеи, и был пионером разработавший метод регионарной химиотерапии злокачественных опухолей, в частности органов головы и шеи. С применением этой методики профессор В.Г.Ходжаев доказал преимущество регионарной химиотерапии в составе комплексное лечения злокачественных опухолей.
Профессор А.А.Фазилов заведовал кафедрой онкологии с 1987г. по 2000г. В начале своей деятельности в 1988 году в составе кафедры онкологии открыл курс ультразвуковой диагностики. С этого момента началась эпоха внедрения УЗД в инструментальной диагностики опухолевых поражений организма человека. За период деятельности профессора А.А.Фазилова подготовлены более ста научных работ, около 20 кандидатских и 2 докторских диссертации посвящённых диагностики и лечению онкологических заболеваний.
С 2001 года по сей день заведующим кафедрой «Онкологии с курсом УЗД» является профессор М.А.Гафур-Ахунов. За последние 10 лет кафедра полностью переоснащена необходимыми педагогическим инвентарём, разработаны новые и переработаны существующие программы тематических циклов и утверждены вышестоящих инстанциях. Разработаны учебная программа и тестовые вопросы для клинических ординаторов. За период деятельности профессора М.А.Гафур-Ахунова выданы в печать более 300 статьи в научных журналах, подготовлены 15 кандидатских и 2 докторских диссертации посвящённых ранней диагностики и комплексному лечению запущенных стадиях злокачественной опухолей. Данный момент проходит этапы оформления и готовится к защите 2 диссертации для получения докторской степени.