Планово-финансовый отдел — отдел, который планирует и обеспечивает средства финансовой деятельности Центра, разрабатывает систему планирования и мероприятия по совершенствованию форм и системы оплаты труда работников Центра и их стимулирования.

Целью отдела является достижение правильного и эффективного использования государственных и денежных средств, выделенных на обеспечение Центра во взаимодействии с бухгалтерией и другими структурами центра.

Основными задачами отдела во взаимодействии с соответствующими подразделениями Центра являются составление планов выделения средств на содержание необходимого количества управленческого и профессорско-преподавательского состава, административно-управленческого персонала и ассистентов преподавателей, разработка таблицы мест административно-учебно-вспомогательного персонала Центра, должностей профессорско-преподавательского состава, административно-вспомогательного персонала, подготовка записей с указанием звания, уровня и звания, подготовка и представление ежеквартальных и годовых отчетов в Министерство здравоохранения Республики Узбекистан, а также разовых отчетов о финансировании и уплате взносов, разработка предложений и мероприятий, связанных с эффективным использованием бюджетных и внебюджетных средств и контроль их исполнения, учитывать и систематизировать инструктивные документы по вопросам планирования и финансовой деятельности, организовывать их исполнение совместно с соответствующими должностными лицами центра.